RT Dissertation/Thesis
T1 Advances in bivalve molluscs immune system:  a genomic approach
T2 Avances en el estudio del sistema inmunitario de moluscos bivalvos : una aproximación genómica
A1 Moreira Sanmartín, Rebeca
K1 2510.92 Acuicultura Marina
K1 2409 Genética
K1 2412 Inmunología
AB Identificación y estudio molecular, mediante PCR cuantitativa, pirosecuenciación y microarrays, de genes relacionados con la respuesta inmunitaria frente a patógenos y también frente a diferentes PAMPs (patrones asociados a patógenos):a) Recopilación y análisis de todas las ESTs que existen en la base de datos de almeja fina y almeja japonesa. Estudio de secuencias relacionadas con el sistema inmunológico.Se realizará una recopilación de todas las secuencias que existen en el Genbank de almeja fina y japonesa con el fin de realizar un envío masivo al Blast y proceder a su anotación. El objetivo de este trabajo es disponer de un registro de las secuencias de genes relacionados con la respuesta inmunitaria en almeja.Posteriormente se clasificarán estas secuencias según su función para evaluar su expresión mediante PCR cuantitativa frente a un estímulo bacteriano.b) PirosecuenciaciónCon el fin de obtener una mayor cantidad de secuencias de almeja implicadas en la respuesta inmune, se llevará a cabo una pirosecuenciación de muestras de almeja, procedentes de ARN de hemocitos estimulados in vitro durante 3 horas con CpG, péptido-glicano, LPS, glucanos, polyI:C, ácido lipoteicoico y bacteria (Vibrio) muerta.Esperamos que el estudio obtenga como resultado un gran número de secuencias nuevas, de las que una gran cantidad estarán relacionadas con el sistema inmunitario de estos moluscos bivalvos, al haber usado un tejido específicamente inmunitario: los hemocitos.c) Microarray de almejaCon las secuencias resultantes de la pirosecuenciación se diseñará un microarray 8x15. Los microarrays se usan para estudiar la expresión de una gran cantidad de genes, en este caso 15.000, y encontrar aquellos que se expresen diferencialmente según las condiciones a las que se sometan las almejas. En este caso se estudiará el estado fisiológico e inmunológico de los hemocitos de almeja después de haberlos sometido a un estímulo bacteriano durante un curso de tiempo.
YR 2015
FD 2015-12-15
LK http://hdl.handle.net/11093/521
UL http://hdl.handle.net/11093/521
LA eng
NO REPROSEED | Ref. FP7 245119
DS Investigo
RD 14-dic-2024