Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Galicia

Abstract

The main objective of this thesis is to carry out real-time computational genomic monitoring of SARS-CoV-2 in Galicia to find out how many new cases are imported or come from local transmission, track transmission chains and new outbreaks in different communities, and monitor the dynamics in Galicia of the genetic variants of the virus with clinical relevance. The aim is to carry out this task through the use of genomic tools and massive data analysis within the EPICOVIGAL project.

El objetivo fundamental de esta tesis es llevar a cabo la monitorización genómica computacional en tiempo real del SARS-CoV-2 en Galicia que permita averiguar cuántos casos nuevos se importan o provienen de la transmisión local, rastrear cadenas de transmisión y nuevos brotes en diferentes comunidades, y monitorizar la dinámica en Galicia de las variantes genéticas del virus con relevancia clínica.Se pretende llevar a cabo este cometido mediante el uso de las herramientas genómicas y el análisis masivo de datos dentro del proyecto EPICOVIGAL.

O obxectivo fundamental desta tese é levar a cabo a monitorización xenómica computacional en tempo real do SARS-CoV-2 en Galicia, que permita determinar cantos casos novos son importados ou proveñen da transmisión local, rastrexar cadeas de transmisión e novos gromos en diferentes comunidades, e monitorizar a dinámica en Galicia das variantes xenéticas do virus con relevancia clínica. Preténdese levar a cabo este cometido mediante o uso de ferramentas xenómicas e a análise masiva de datos dentro do proxecto EPICOVIGAL.